Le logis principal est daté du 17e siècle. Au 19e siècle, vers 1890 un pavillon est ajouté au bâtiment déjà existant et la décoration des intérieurs est refaite.
Ce manoir situé jusqu'en 1864 sur la commune de Pluduno, connaît des noms différents suivant les époques. En effet dans les documents les plus anciens le site est nommé Ville Menou, aux 17e et 18e siècles, il est aussi appelé parfois Ville Meneuc (cadastre ancien de 1827) ou Ville Meneust (Carte de Cassini).
Le nom de La Villemeneust est mentionné pour la première fois au 15e siècle, Richard de Lesquen (né vers 1430) est alors seigneur du lieu. Il est le descendant d'une famille très ancienne originaire du diocèse de Quimper, dont un ou plusieurs membres auraient migré à Pluduno, où un château dont il ne reste aucune trace aujourd'hui, aurait été construit (site de Lesquen à Pluduno, mentionné dans les conclusions de la réformation de la noblesse de Bretagne de 1668).
Le manoir restera propriété de la famille de Lesquen jusqu'en 1786, date à laquelle décède le second et dernier marquis de la Villemeneuc. Lors de la révolution la propriété revient à la famille de Margeot, dont Alphonse de Margeot connu sous la Restauration pour ses positions contre les idées des Lumières et l'irréligion. Son fils Charles introduit l'élevage de chevaux de courses à la Villemeneuc, activité qui perdure jusqu'à l'entre-deux-guerres.