Il existait quatre moulins sur la commune au milieu du 19e siècle. L'unique moulin à vent, le moulin de Terre Rouge, a disparu. Des trois moulins à eau que comptait Bonnemain, seul celui de Montferrand, attenant à l'ancienne métairie du même nom, a disparu. Le moulin de Montsorel, à cheval sur les communes de Bonnemain et de Baguer-Morvan, a été transformé en habitation entre 1850 et 1900 ; il fonctionnait encore en 1808 et 1813 comme le rapporte les sources archivistiques. Le moulin à eau de la Chaise est aujourd'hui en mauvais état. Sa roue est les mécanismes internes ont été retirés mais le bâtiment principal n'a pas été modifié. Datable du 16e siècle (?), il est l'un des plus moulins à eau encore visible dans le département Ille-et-Vilaine avec ceux d'Iffendic (moulin du Breil, 1567), de Bruz (moulin du Boël, 1652), de Mézière-sur-Couesnon (moulin de la Roche, 1798).

A noter, l'atelier de menuiserie de la Perrine, témoin de l'activité artisanale bonnemainésien du milieu du 20e siècle, conserve ses machines.